Resmi tez, teröristlerin yapmayı planladıklarından daha başarılı bir eylem gerçekleştirdiklerini söylerken, komplo teorileri, 11 Eylül olaylarının tam da istendiği şekilde sonuçlandığını öne sürmektedirler. Saldırılar öncesi bilgilerin yetkililer tarafından gözardı edildiği ve gereğinin yapılmadığına ilişkin teoriler şu bilgilere dayanmaktadır. Üç FBI ajanı, zamanında Bill Clinton’u suçlayan savcı David Schippers’la temas kurmuş ve aşağı Manhattan’a yönelik olası bir saldırı konusunda bilgi vermişlerdir. Schippers, saldırılardan beş hafta kadar önce konu hakkında Başsacvı John Ashcroft’ya bilgi verip soruşturma açılmasını istediğini ama ondan Adalet Bakanlığının soruşturma açmadığı cevabını aldığını söylemiştir.